In questa nuova avventura i giocatori sono chiamati a esplorare un ampio mondo di gioco e incontrare Yo-kai di vari tipi e dimensioni che possono reclutare per formare una squadra con cui combattere gli Yo-kai malvagi e dare una mano a chi ne ha bisogno. È possibile prendere il treno per visitare nuove città e scoprire nuovi Yo-kai. Insieme a Hovernyan leroico gatto i giocatori dovranno andare indietro nel tempo per salvare Valdoro e scoprire le origini dello Yo-kai Watch! Una forza sinistra ha innescato una guerra fra due fazioni di Yo-kai gli Spiritossi e le Polpanime provocando una gran confusione in tutto il mondo. Nathan e i suoi amici devono viaggiare nel tempo per scoprire chi ha tessuto questa malvagia trama... Nel corso dellavventura il giocatore incontrerà diversi volti noti già presenti del primo YO-KAI WATCH tra cui Nathan e Katie Whisper e Jibanyan Sandrone e Pier e tanti altri ai quali si aggiungono tanti nuovi volti per unavventura più entusiasmante che mai! Che si sce