Ein flüchtiger Alchemist mit geheimnisvollen Fähigkeiten führt die Elric-Brüder in ein fernes Tal mit Slums, die von den Milos bewohnt werden, einem stolzen Volk, das gegen bürokratische Ausbeutung kämpft. Ed und Al finden sich schnell inmitten einer aufkommenden Rebellion wieder, als die verbannten Milos gegen ihre Unterdrücker aufbegehren. Im Mittelpunkt des Konflikts steht Julia, eine junge Alchemistin, die sich mit Alphonse anfreundet. Sie wird vor nichts zurückschrecken, um den Milos wieder zu altem Glanz zu verhelfen - selbst wenn das bedeutet, sich die schreckliche Macht des mythischen Steins der Weisen zunutze zu machen.